Il Dummy System (ダミーシステム, Damī shisutemu) è un sistema che imita i tracciati di pensiero di un pilota allo scopo di sincronizzarsi con un Evangelion[1]. A bordo dell'Eva-01 viene inserito un modello che imita la personalità del First Children Rei Ayanami. Si ritiene che Rei sia stata scelta per via della sua stabilità psicologica[2]. Questo sistema viene attivato durante la battaglia con il tredicesimo Angelo, secondo un ordine dettato dal comandante in capo, Gendō Ikari. Le sue azioni in battaglia, assai diverse rispetto al pilotaggio della First Children, si avvicinano ad uno berserk[3]. Con l'attivazione del Dummy System, lo 01 inizia un feroce attacco nei confronti dell'Eva-03, e anche quando il nemico è ormai inerme, l'umanoide continua ad aggredirlo violentemente, strappandogli la corazza e facendo a pezzi il suo corpo[4].
Nel film Evangelion 2.0, secondo della tetralogia cinematografica Rebuild of Evangelion, il Dummy System ha un altro design e una schermata d'avvio differente.